Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem200cJ3QK46 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms