Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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