Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm20828J3KMI7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm20828J3KMI7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20828J3KMI7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20828J3KMI7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20828J3KMI7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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