Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms