Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 A730065G17Rik-201ENSMUST00000217082 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dst-205ENSMUST00000182314 2643 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rsph14-203ENSMUST00000159994 1728 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Wdr61-202ENSMUST00000118771 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm37829-201ENSMUST00000193864 2213 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 4930509G22Rik-201ENSMUST00000181206 2481 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ctcflos-204ENSMUST00000153523 3476 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Lpin1-205ENSMUST00000221297 3100 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm3364-201ENSMUST00000196016 1217 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Top3a-201ENSMUST00000002891 3741 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Swt1-201ENSMUST00000064771 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Phc1-202ENSMUST00000081849 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Pcx-201ENSMUST00000068004 4148 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 AC160550.2-202ENSMUST00000227812 1861 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms