Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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