Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn2r40F6W043 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vmn2r40F6W043 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms