Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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R3hdm1E9Q9Q2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
R3hdm1E9Q9Q2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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