Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm3020E9Q3J7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm3020E9Q3J7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm3020E9Q3J7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm3020E9Q3J7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm3020E9Q3J7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3020E9Q3J7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms