Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3250E9Q1M3 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms