Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms