Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Usf3B2RUQ2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms