Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Trabd2bB1ATG9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms