Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Scn3aA2ASI5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Scn3aA2ASI5 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Scn3aA2ASI5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Scn3aA2ASI5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Scn3aA2ASI5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Scn3aA2ASI5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Scn3aA2ASI5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Scn3aA2ASI5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Scn3aA2ASI5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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