Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SetxA2AKX3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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