Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Top3bQ9Z321 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Top3bQ9Z321 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
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Top3bQ9Z321 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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