Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vamp5Q9Z2P8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms