Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms