Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nek3Q9R0A5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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