Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms