Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms