Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI1

Fam89b, Leucine repeat adapter protein 25, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam89bQ9QUI1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam89bQ9QUI1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms