Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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SacsQ9JLC8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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SacsQ9JLC8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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SacsQ9JLC8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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SacsQ9JLC8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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SacsQ9JLC8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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