Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gde1Q9JL56 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms