Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms