Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Chrac1Q9JKP8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms