Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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