Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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