Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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Tspan4Q9DCK3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms