Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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