Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnot8Q9D8X5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnot8Q9D8X5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnot8Q9D8X5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnot8Q9D8X5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnot8Q9D8X5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnot8Q9D8X5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnot8Q9D8X5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms