Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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