Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl3Q9D8K3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl3Q9D8K3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms