Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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Borcs6Q9D6W8 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Borcs6Q9D6W8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms