Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PudpQ9D5U5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms