Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms