Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms