Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CWU4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms