Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn3Q9CVD2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms