Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms