Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PsenenQ9CQR7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PsenenQ9CQR7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PsenenQ9CQR7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PsenenQ9CQR7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PsenenQ9CQR7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PsenenQ9CQR7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PsenenQ9CQR7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PsenenQ9CQR7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PsenenQ9CQR7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PsenenQ9CQR7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PsenenQ9CQR7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms