Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms