Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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