Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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