Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hdac9Q99N13 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hdac9Q99N13 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hdac9Q99N13 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hdac9Q99N13 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hdac9Q99N13 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hdac9Q99N13 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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