Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Nus1Q99LJ8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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