Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Sh3bp5lQ99LH9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sh3bp5lQ99LH9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sh3bp5lQ99LH9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sh3bp5lQ99LH9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Sh3bp5lQ99LH9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Sh3bp5lQ99LH9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Sh3bp5lQ99LH9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Sh3bp5lQ99LH9 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Sh3bp5lQ99LH9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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