Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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