Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ssh3Q8K330 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ssh3Q8K330 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ssh3Q8K330 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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