Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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